本篇介紹如何在 Python 中使用 NiBabel 或 SimpleITK 模組讀取並顯示 NIfTI 影像(.nii
、.nii.gz
)。
ITK
ITK 以 LabelStatisticsImageFilter 套用遮罩影像計算統計量教學與範例
介紹如何使用 ITK 的 LabelStatisticsImageFilter
套用遮罩影像計算各種統計量,包含體積(數量)、加總、平均值、變異數、範圍等。
Python 使用 ITK 讀取、寫入、建立影像教學與範例
介紹如何在 Python 中以 ITK 模組讀取、寫入影像檔案,以及自行建立 ITK 影像的方法。
ITK 計算 3D 二元遮罩影像物件數量與體積
介紹如何在 Python 中使用 ITK 函式庫計算 3D 二元遮罩影像中的物件數量與體積。
SimpleITK 計算 2D 二元遮罩影像物件數量與統計值
介紹如何在 Python 中使用 SimpleITK 的 ConnectedComponent
取出二元遮罩影像中的物件,計算物件數量與統計值。
Jupyter 以 itkwidgets 比較兩個影像差異教學與範例
介紹如何在 Jupyter 環境中使用 itkwidgets
的棋盤式與並列式影像比較圖,比較兩張 3D 影像的差異。
ITK 樣條曲線 BSpline 非剛性影像對準教學與範例
介紹如何使用 ITK 的樣條曲線(BSpline)轉換對 2D 影像進行非剛性影像對準。
ITK 有限元素法影像對準 FEM Registration 教學與範例
介紹 ITK 所提供的有限元素法影像對準的使用方式,並提供基本的範例程式碼。
ITK 儲存、載入影像 Transform 轉換參數教學與範例
介紹如何使用 ITK 的 TransformFileWriter
與 TransformFileReader
寫入與讀取各種 Transform 影像轉換與參數。
ITK 多階段 Multi-Stage 影像對準架構教學與範例
介紹如何在 ITK 的多階段(multi-stage)影像對準架構下,組合平移對準(translation registration)與仿射對準(affine registration)。